环境监测系统用于表征和监测环境质量。环境监测用于环境影响评估，以及评估人类的各种活动对环境产生有害影响的风险。所有监测策略和措施都必须证明其自身的有效性和合理性，其设计能够表征环境状态或建立环境参数的趋势。监控结果都需要审核，分析和公开。

空气中的细菌和真菌细胞和孢子可能存在于液滴中，比如生物气溶胶。非常小颗粒会更长时间的悬浮在空气中，较大的颗粒会聚拢并积累，从而迅速沉降至物体表面。它们是传染的重要来源并会导致污染。因此，监测空气中的微生物是环境监测的关键组成部分。空气微生物数量监测主要有两种方法：被动监测和主动采样。主动采样方法已成为一种重要的环境监测手段，尤其在制药和医疗器械行业。

浮游菌采样器使用主动采样法，用于检测活性真菌、孢子和细菌。